SMK Negeri 2 ternate memiliki OSIS (Organisasi Siswa Intra Sekolah) sebagai wadah penyaluran minat, bakat, dan kemampuan siswa serta pengembangan ilmu pengetahuan . Di samping itu juga OSIS berperan sebagai pendamping sekolah dalam mengawasi aktifitas siswa dan pelaksanaan program sekolah.

Seksi-seksi OSIS SMK Negeri 2 Ternate:

1. Seksi Kepercayaan Terhadap Tuhan Yang Maha Esa
2. Seksi Kehidupan Berbangsa dan Bernegara
3. Seksi Pendidikan Pendahuluan Bela Negara
4. Seksi Kepribadian dan Budi Pekerti Luhur
5. Seksi Berorganisasi, Pendidikan Politik dan Kepemimpinan
6. Seksi Keterampilan dan Kewiraswastaan

Dalam Pembinaan minat dan bakat siswa maka di SMK negeri 2 Ternate, maka dikembangkanlah kegiatan ekstrakurikuler yang meliputi:

1. Pramuka
2. Paskibra
3. Palang Merah Remaja (PMR)
4. Patroli Keamanan Sekolah (PKS)
5. Pecinta Alam (PA)
6. Olahraga (Bola Voli, Bola Basket, Karate, Tenis Meja, Bulu Tangkis)
7. Kerohanian